El colegio fue creado por la parroquia Nuestra Señora de Moratalaz el 24 de Julio de 1.962, aunque en sus comienzos formaba parte del Complejo parroquial "Sta. Lucía". En Septiembre de 1.963 comenzó a funcionar el Colegio Parroquial Nuestra Señora de Moratalaz. El colegio comenzó con tres aulas: una de párvulos, una de chicas y otra de chicos. Además de las clases había un ambulatorio con sala de curas e inyecciones, rayosX y dependencias de la parroquia: cáritas, ropero y despachos.

Los primeros profesores que tuvo el Colegio fueron:

• Sor Mª José Carrión (religiosa) en párvulos
• Dª Alejandrina Álvaro, en el aula de las chicas
• D. Juan Ripollés, en el aula de los chicos.

En el curso 1.967/1.968 se amplió hasta seis clases. Pero fue en el curso 1.970/1.971 cuando se implantó la E.G.B. y en el curso 1.999/2.000 cuando se completaron las aulas que actualmente están en funcionamiento: tres aulas de Educación Infantil, seis aulas de Educación Primaria y cuatro de Educación Secundaria

Han sido párrocos y responsables del colegio:

• D. Ramón Lledó (fundador del colegio)
• D. Julián Bedoya
• D. José Blanco
• D. Rafael Rojo
• D. Enrique Hernando
• D. Juan Fernández
• D. Jaime Arrieta
• D. Juan Ortiz (actual)