Los científicos lograron trasladar a España más de 80 mil objetos de la cultura y naturaleza americana. En 1866 se creó la Comisión de estudio de esas colecciones, pero tuvo grandes problemas ya que había bastantes diferencias entre los naturalistas españoles. POr eso en 1885 los resultados obtenidos de esta comisión no fueron los esperados.

La mayor parte de esas colecciones quedaron en el Jardín Botánico desde 1866 hasta 1879 y 1880 cuando fueron trasladadas al Museo Nacional de Ciencias Naturales. A finales del siglo XIX se volvieron a trasladar a otro museo conocido como el Museo Arqueológico Nacional y finalmente se trasladó al Museo de América donde están situadas actualmente.