El IES Manuela Malasaña no dispone de Comedor Escolar, propiamente dicho. Sin embargo, el Consejo Escolar del Centro, preocupado por proporcionar a los alumnos del centro una Educación de Calidad y con las mejores condiciones posibles, ha acordado con la contrata del servicio de cafetería del centro, habilitar en la misma un área dotada de mesas y sillas para los alumnos. Además de cualquier otro producto de la cafetería, se sirven menús especiales para alumnos a precios adsequibles (y que aprueba anualmente el Consejo Escolar)