En el IES Juana de Castilla se imparten las siguientes enseñanzas:

• Educación Secundaria Obligatoria (ESO): 1º, 2º, 3º y 4º.
• Diversificación Curricular: 3º y 4º ESO.
• Bachillerato: 1º y 2º, en sus modalidades de Humanidades, Ciencias Sociales y Científico-Tecnológico.